Créée par la loi Loi n° 88-91 du 2 août 1988, elle constitue l'organisme d'intervention principal du Ministère de l'Environnement et a une double mission :
- Analyser l'état de l'environnement du pays et
- Suivre l'évolution de l’environnement d'une part, et lutter contre toutes les sources de nuisance et de dégradation du milieu naturel d'autre part.
Pour lutter contre la pollution, elle mène des actions préventives tel que l’examen des études d'impact sur l'environnement dont l'approbation par l'ANPE est obligatoire avant la réalisation de tout nouveau projet, la participation à l'élaboration de normes de pollution, la promotion de la protection de l'environnement et la sensibilisation du public, la formation et l’encrage de l'éducation environnementale dans tous les secteurs et pour tous les âges.
L’ANPE entreprend également des actions curatives en remplissant le rôle d'inspecteur des rejets polluants et des installations de traitement de ces rejets et en veillant à l'application et au respect de la législation en vigueur.
l'ANPE est habilitée à intenter devant les tribunaux toute action visant à obtenir la réparation des dommages écologiques causés par les contrevenants aux lois. Elle agit également de manière initiative en passant des conventions avec les entreprises en infraction pour quelles remédient aux pollutions et dégradations qu'elles engendrent.
L'ANPE gère le fonds de dépollution (FODEP) destiné à apporter une aide financière et fiscale aux entreprises désirant mettre en place des équipements de dépollution conformément au décret n° 93-2120 du 25 octobre 1993, fixant les conditions et les modalités d'intervention du fonds de dépollution. En ce qui concerne les avantages fiscaux, ils sont prévus par Loi n° 2001- 82 du 24 juillet 2001, portant modification du code d'incitation aux investissements promulgué par la loi n° 93-120 du 27 décembre 1993.